心血管内科始建于1980年，是省内较早成立的小儿心血管中心之一。心血管内科设有病房、心脏超声室、心电图室、心功能检查室、直立倾斜试验检查室和心导管室等。是省内具备小儿先天性心脏病介入资质的两家儿童专科医院之一。2014年成立苏州市儿童心脏及血管疾病重点实验室，承担着江苏省及邻近省市儿童心血管疑难疾病的诊治及教学、科研任务。2016年成为江苏省临床重点专科、苏州市重点学科。2017年先天性心脏血管病一体化诊疗中心成为江苏省妇幼健康重点学科，并响应苏州健康531规划，全面开展全市婴幼儿先心筛查工作。与上海、北京等各儿童心血管中心学术交流频繁、联系紧密。2018年引进北京阜外医院心血管专业院士及专家团队进行科研、临床多方位的交流合作。

本专科为儿科学博士点、硕士点单位，拥有博导2名，硕导4名；高级职称9名，博士和在读博士8名，所有专科医师均为硕士以上学历。学科带头人3人，均为全国性学术委员会委员。本专科承担国家自然基金课题项目9项，省级和市厅级科技项目20项。获得国家级、省级科技及新技术奖9项，市级科技奖8项。

主要开展的专科技术：1.心导管、心血管造影诊断技术。2.常见、疑难先心病介入治疗技术及新生儿危重症肺动脉瓣狭窄介入治疗技术。3.先天性心脏病的镶嵌治疗技术。4.儿童心律失常的诊治、儿童射频消融术、儿童临时起搏和永久起搏器安装术。5.川崎病的规范化诊疗及冠状动脉损害的长期治疗管理。6.心肌炎、心肌病、心包炎规范化诊治技术及长期随访管理。8.各种原因导致的心功能不全诊治技术。9.儿童血管迷走性晕厥诊治技术。10.儿童高血压及肺动脉高压的规范化诊治技术和长期随访管理。11.儿童遗传性心律失常的基因诊断和精准治疗。12.疑难心脏病的诊治技术等。